La startup française Bioptimus, fondée par d'anciens chercheurs de Google DeepMind et d'Owkin, a récemment dévoilé H-optimus-0, un modèle de langage open-source spécialisé dans l'analyse de tissus cancéreux. Ce développement marque une étape significative dans l'ambition de Bioptimus de transformer l'approche de la biologie avec l'intelligence artificielle.

Une innovation dans le diagnostic médical

Le modèle H-optimus-0 de Bioptimus représente une avancée notable dans le domaine de l'intelligence artificielle appliquée à la santé. En utilisant ce modèle, les professionnels de la santé peuvent non seulement identifier le type de cancer chez un patient, mais également détecter des anomalies génétiques et prédire les traitements les plus efficaces. Cette technologie promet de révolutionner le diagnostic médical en rendant les processus plus rapides et plus précis.

En juillet, après une levée de fonds de 35 millions d'euros impliquant des acteurs majeurs comme Sofinnova Partners et Bpifrance, Bioptimus a publié ce modèle en open-source, encourageant ainsi la collaboration et l'innovation dans le secteur médical global.

Des ambitions étendues pour comprendre la biologie

Bioptimus ne se contente pas de rester à la surface des applications médicales de l'IA. L'entreprise vise à développer un modèle général qui pourrait encapsuler toute la complexité de la biologie, de la molécule au patient. Jean-Philippe Vert, cofondateur et président de Bioptimus, compare cette ambition à celle des modèles de langage comme GPT d'OpenAI, qui a appris à comprendre le langage humain en analysant d'immenses quantités de texte.

De manière similaire, Bioptimus nourrit son modèle avec une vaste gamme de données biologiques pour qu'il puisse, à terme, maîtriser l'« essence de la biologie ». Cette approche pourrait dépasser les capacités des modèles existants, tels que Alphafold de Google DeepMind, qui se concentre uniquement sur le repliement des protéines.

Bioptimus s'appuie sur une large base de données

Pour réaliser ses objectifs ambitieux, Bioptimus s'appuie sur une large base de données, incluant des séquences ADN, des images de cellules et des dossiers cliniques. L'entreprise a acquis des données anonymisées de plus de 4,000 hôpitaux aux États-Unis, représentant environ 400,000 patients. En outre, Bioptimus utilise la base de données "Mosaïc" d'Owkin, qui offre un atlas détaillé de cellules cancéreuses.

En septembre, avec une équipe de 17 salariés, Bioptimus envisage de vendre l'accès à son modèle de fondation à des entreprises pharmaceutiques et biotechnologiques, favorisant ainsi le développement d'applications diverses allant du diagnostic à la création de nouvelles protéines. Cette stratégie pourrait significativement améliorer les soins de santé à l'échelle mondiale.